La Dirección de Investigación es la dependencia encargada de fomentar y coordinar las actividades universitarias de investigación y desarrollo tecnológico y los estudios sobre el desarrollo socio-económico de la costa norte colombiana y de asegurar la correcta difusión de los resultados de estas actividades. Así mismo coordina la prestación de servicios universitarios al sector externo, interno y administra los proyectos especiales y la publicación que le encargue la Rectoría.